American Journal of Biological and Environmental
Statistics
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Molecular Characterization of Canine Rabies Virus Strains
Circulating in Mali
Sow Ibrahim
1, 2
, Dakouo Marthin
2
, Coulibaly Kadidiatou
2
, Diakité Mohamed Adama
2
,
Koné Yaya Sidi
2
, Diakité Adama
2
, Sidibé Satigui
2
, Babana Amadou Hamadoun
1
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Environmental Statistics:/%// !"
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Abstract:
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Keywords:
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1. Introduction
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2. Material and Methods
2.1. Study Site
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2.2. Collecting Samples
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2.3. Diagnostic Techniques
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2.3.2. Method for Detecting the N Gene of Rabies Virus by
RT-PCR
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Table 1. Concentration and volume of reagents used.
Name of reagents /initial concentration
Final concentration Volume for 1 reaction (µl) Volume for 15 reactions (µl)
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Table 2. Primers used.
Name of reactions Codes de la compagnie Conservation condition
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M, P9RP9
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Table 3. Amplification program.
Reverse
Transcription
Inactivation de la RT-PCR et
activation de la Taq polymérase
PCR
Élongation
finale
Conservation
Dénaturation Hybridation Élongation
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2.3.3. Sequencing of Identified Rabies Virus Strains
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3. Results and Discussion
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Table 4. Summary of analyzes of variance for virus identification tests, specimens and test-specimen interaction.
Variables DDL
Moyenne des carrés
Détection des virus
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Table 5. Test efficiency.
Tests Number of observation Average virus presence
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Figure 1. Results of the detection of bands in PCR.
Table 6. Presentation of samples showing the areas of provenance, the cycle threshold (Ct) and the subgroup of the Africa 2 line to which the sample belongs.
Samples ID number Area of origin Quantitative RT-PCR C
t
Africa 2 lineage subgroup
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Figure 2. Africa 2 rabies virus identified in Mali and neighboring countries.
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Figure 3. Phylogenetic tree obtained after sequencing the RNA of rabies viruses.
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4. Conclusion
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References
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